A genetic linkage map of Silene vulgaris based on AFLP markers

Author： Bratteler Martin Lexer Christian Widmer Alex

ISSN： 0831-2796

Source： Genome, Vol.49, Iss.4, 2006-04, pp. : 320-327

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Abstract

A genetic linkage map of an intraspecific cross between 2 Silene vulgaris s.l. ecotypes is presented. Three-hundred AFLP markers from 2 different restriction enzyme combinations were used to genotype an F₂ mapping population. Maternal and paternal pure-coupling phase maps with 114 and 186 markers on 12 and 13 linkage groups, respectively, were constructed. Total map length of the paternal and maternal maps are 547 and 446 Kosambi cM, respectively. Nearly half of the markers (49%) exhibited significant transmission ratio distortion. Genome coverage and potential causes of the observed segregation ratio distortions are discussed. The maps represent a first step towards the identification of quantitative trait loci associated with habitat adaptation in the non-model species Silene vulgaris.Key words: AFLP, genome mapping, segregation distortion, Silene vulgaris.Une carte génétique, produite à partir d'un croisement intraspécifique entre deux écotypes du Silene vulgaris s.l., est présentée. Trois cents marqueurs AFLP obtenus à l'aide de 2 combinaisons d'enzymes de restriction ont été employés sur une population de cartographie F₂. Des cartes maternelles et paternelles, en couplage pur, constituées respectivement de 114 et 186 marqueurs groupés en 12 et 13 groupes de liaison ont été produites. La longueur totale de la carte paternelle est de 547 cM alors que la carte maternelle totalise 446 cM avec la fonction Kosambi. Près de la moitié des marqueurs (49 %) montraient une distorsion significative de la ségrégation. L'étendue de la couverture génomique et les causes potentielles des distorsions de la ségrégation sont discutées. Ces cartes constituent un premier pas en vue de l'identification de QTL associés à l'adaptation à l'habitat chez l'espèce non-modèle Silene vulgaris.Mots clés : AFLP, cartographie génétique, distorsion de la ségrégation, Silene vulgaris.[Traduit par la Rédaction]