Abstract
Pandanus fascicularis L. is a dioecious plant native to South Asia with significant numbers in coastal areas. With the aim of distinguishing male genotypes from female genotypes early in the vegetative growth phase, the current study was initiated using molecular markers. Based on the principle of bulked segregant analysis, the sampled plants were separated into 2 bulks depending on their sex. Of the 89 random amplified polymorphic DNA and inter-simple sequence repeat markers used, one decamer (OPO-08) consistently amplified a 1263 bp band in the males that was absent in the females. Its DNA sequence did not exhibit significant similarity to previously characterized sequences, but the presence of mononucleotide and dinucleotide repeats suggested that it was a repeat-rich region. A sequence-characterized amplified region marker (MSSRF-01) designed for this fragment continued to amplify the specific allele in all the male plants. Southern hybridization performed using the sex-specific fragment as a probe yielded results consistent with those previously obtained by polymerase chain reaction. These results strongly suggest that MSSRF-01 is a male-specific molecular marker. With no information available on the presence of sex chromosomes in Pandanus, this marker can be used to differentiate the sexes.Le Pandanus fascicularis L. est une plante dioïque originaire du Sud de l’Asie et très présente dans les régions côtières. Afin de distinguer les génotypes mâles des génotypes femelles tôt au cours de la phase végétative, la présente étude a été initiée avec des marqueurs moléculaires. En s’inspirant du principe de l’analyse des ségrégants regroupés, les plantes analysées ont été séparées en deux groupes sur la base de leur sexe. Des 89 marqueurs RAPD (ADN polymorphe amplifié au hasard) et ISSR (inter-microsatellite) employés, une amorce décanucléotidique (OPO-08) a amplifié de façon constante un amplicon de 1263 pb chez les mâles alors que celui-ci était absent chez le femelles. La séquence d’ADN de l’amplicon ne montre aucune homologie significative avec les séquences connues, mais la présence de répétitions mono- et dinucléotidiques suggère qu’il s’agit d’une région riche en ADN répétitif. Un marqueur SCAR (région amplifiée de séquence connue) mis au point à partir de l’amplicon, MSSRF-01, a continué à amplifier l’allèle spécifique chez tous les plants mâles. Des hybridations Southern employant comme sonde l’amplicon spécifique du sexe ont confirmé les résultats obtenus par réaction de polymérisation en chaîne. Ces résultats suggèrent fortement que MSSRF-01 est un marqueur spécifique du sexe mâle. En l’absence d’information quant à la présence de chromosomes sexuels chez le genre Pandanus, ce marqueur peut servir à différencier les sexes.
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